崇祯这边收到信后，大骂刘元昭狼子野心，温体仁劝慰崇祯，或许刘元昭是真的好心。
崇祯怒道：“好心？这是什么好心，又是划地盘，又是给种子的，这是让流寇寄居在大明身上！到了某个时刻，就给朕闹出一个篓子！”
温体仁回道：“那陛下是要拒绝吗？如此，流寇牵扯我们大部分精力，北方的女真鞑子怕是会趁机攻打我们了。”
崇祯闭眼叹气道：“此事先拖着，让山西各路官兵继续剿匪。”
此事搁置后，刘元昭见明廷没有回音，便让苏泰丰返回。
十一月，高迎祥、李自成、张献忠、罗汝才等突破明军防线，于毛家寨渡黄河，陷渑地。十二月下宜阳、卢氏、内乡至南阳(今皆属河南)遂入湖广。破夔州(今四川奉节)逼四川。明军所在告急。
这时候崇祯急了，他连忙派人去找刘元昭，希望他派人去与流寇谈判，让他们接受明廷招抚。
刘元昭将书信搁置，对此事不理不睬。
因此，崇祯再度怒斥刘元昭背信弃义，意欲切断互市。
首辅温体仁赶紧劝慰道：“陛下，如今我们已经与女真鞑子敌对，如果再惹怒刘元昭，那真是不堪重负了！陛下三思！”
崇祯怒视温体仁，说道：“就把粮食等紧俏物资拦下，如今朝廷正是缺粮食，为何这些商人还有粮食出口国外？
都是奸商，让锦衣卫给朕查，抓起来，抄家！全部充公！”
刘元昭对于崇祯的举动很是不满，于是派人向辽东地界散布明廷内部的不少重要消息。
十二月，甘肃西和有约六级地震，震中烈度为七至八。
刘元昭治下归德都督府的洮州卫和临洮府都有震动。
此事一发生，言官皆言此事是崇祯德行不够，上天惩罚，崇祯不得已下了罪己诏，平息各路言论。
很快，崇祯六年过去，崇祯七年到来，广鹿岛(位辽东半岛东南海中)副将尚可喜降于金。
尚可喜字元吉，号震阳，祖籍山西洪洞，后至河北衡水，明万历四年（1576年）其祖父尚继官举家迁往辽东海州（今辽宁海城）。
尚可喜戎马一生，身经百战，转战数万里，为清王朝的建立和巩固立下了汗马功劳，在清代历史上写下了浓重的一笔。
康熙年间，晋封为平南亲王。康熙十五年（1676年）十月二十九日，平南王尚可喜在广州薨逝，享年七十三岁。康熙皇帝赐谥曰敬。
孔有德在海上被黄龙杀得抱头鼠窜，损兵折将，认为是平生奇耻大辱，发誓必报此仇。待得安顿好部属，就撺掇皇太极攻打旅顺。
皇太极一直也以明军占据旅顺威胁沈阳南路耿耿于怀，孔有德此议正中其下怀。崇祯六年六月，皇太极命贝勒岳托、德格类、多铎，汉军石廷柱等率马步兵一万出击旅顺，孔有德、耿仲明率所部随征。
自从尚可喜皮岛救驾后，黄龙甚为感激，委以重任，信用甚专。海上堵截孔耿，尚可喜勇打头阵，斩获甚重。
孔耿逃脱后，黄龙命尚可喜驻防鹿岛，离旅顺约有六七百里，三五天内两下里接应不上。七月初四，后金军从陆路由北而南围攻旅顺。黄龙得报，知道来者不善，急忙派人出海调尚可喜回援，同时奋力抵抗。
坚守三日之后，七月初六，后金军攻上旅顺城，黄龙仍然指挥部队殊死战斗，被围数重，苦战不得出。
眼看突围无望，黄龙将朝廷赐给他的征虏前将军印信交给部将谭应华，用他耳鼻尽失后特有的音质含混不清地叮嘱，让谭应华奋力突围，把印信带到登州上交朝廷，如冲不出去，就将印信丢入大海，说完之后，向南跪拜，自刎而亡。
守城明军数千人大部分阵亡，后金军也死伤数千。尚可喜的家眷都在旅顺，城破之后他的几位夫人不甘受辱都投海而死。
黄龙生性贪鄙，当了东江总兵之后，私欲恶意膨胀，大肆吞剥军饷，比毛文龙犹有过之，其贪欲之强之奇足可载入史册，由此给了暗中窥视总兵之位的沈世魁利用兵变发难之机。
演武场上，一顿折辱，黄龙耳鼻尽失，威严扫地。后虽经尚可喜将其救出，但黄龙羞惭无地，五官不全，已无颜号令三军。最后离开皮岛这个伤心之地，率偏师来到旅顺驻扎。
孔耿忿于海上之仇，勾引后金围攻旅顺，必欲杀黄龙而后快。
后金有了孔耿做向导和帮凶，如虎添翼，从兵力、火力等诸方面都占了压倒优势，黄龙孤军作战，已无幸理。
黄龙很清楚，此刻如果弃甲而降，性命必然无忧，所受礼遇应该不在孔耿之下，是所谓识时务之举。
也许是耳鼻尽失后已经了无生趣，也许是想起朝廷对他的厚恩，也许是为了洗刷他曾经的贪腐恶名，在生死关头，黄龙放弃了生，选择了死。
在与后金作战到最后一刻，给进犯之敌以重大杀伤后，以武将充满尊严自刎而亡的方式，实现了取义成仁，大节无亏，可谓忠烈矣！
旅顺失陷，明军失去了辽河以东的最后一个据点，孙承宗、袁崇焕等设想的由辽南四卫金复海盖会同关宁锦东西夹击的战略也就失去了实现基础。
尚可喜接到黄龙的告急文书，火速从鹿岛回师旅顺，可是两地来回千里，岂能一日飞度？
等他开到今大连以东洋面的三山岛，得知旅顺城已破，尚可喜悲痛欲绝，向南痛哭，在船上设置灵堂祭奠黄龙及自家家属，扬帆南下，驶往登州。
旅顺失陷、黄龙丧命，尚可喜成了无根之草，他想回东江，但执掌皮岛大权的是沈世魁，容他不得。他
只得向南到登州上岸，请求安插。这时高起潜、朱大典都在登州，他们知道尚可喜皮岛救主，颇具勇略，是个人才，一齐向朝廷举荐，崇祯同意破格擢用。
登莱当局随即委任尚可喜为三岛副将，属登莱管辖，仍让其上海岛安插。
尚可喜开到登州，就是觉得海岛难以容身，现在又让他上海岛，很不乐意，又提出要回宁远，等了月余，关宁方面也无回音。无奈之下，带领人马掉头又回到他的老巢鹿岛。
黄龙死后，明廷命沈世魁接任皮岛总兵。沈世魁夙愿得偿，成为东江大帅。他听说尚可喜又回到鹿岛，不由得动了杀心。
当日沈世魁伙同耿仲裕假借兵变将黄龙拿住，逼得他让出总兵之位，眼看就要成功，半路杀出个尚可喜，将黄龙救出，破了他总兵之梦。
后来黄龙听到沈世魁也和耿仲裕一伙的传闻，气炸肺腑，当即要将沈世魁拿下，还是尚可喜多方劝解，黄龙才按住火气，吓得沈世魁三魂出窍。
照说沈世魁应该对尚可喜感恩戴德，可是世上有知恩图报之人，更有恩将仇报之人，沈世魁恰恰属于后者。
沈世魁派人传令，调尚可喜来皮岛。尚可喜不敢怠慢，从鹿岛出发，向东而行，中途遭遇飓风不能前进，在海上漂泊。
数日之内连续接到沈世魁几道调令，命他急赴皮岛，而且各营将领十余人都有书信敦促尚可喜速来皮岛，语气殷勤，令人感动，其中却无平日与他交厚之将领。
尚可喜看罢书信，独坐舟中，听得海上波涛阵阵，心绪如潮。仰天长叹“沈世魁币厚言甘，定无好意。可叹我为国征战，海上立功，出生入死，于今十载，父母妻儿尽死于敌手，仅余一身。本想效忠皇上，怎奈奸佞当道，非但不能容我，竟欲杀我而后快，天下事可知矣”言罢振衣而起，下令掉转船头驶回鹿岛。尚可喜回到鹿岛，已经打定主意，也走孔耿道路，投奔皇太极。
崇祯六年十二月，尚可喜写书信一封派人送往沈阳请降。皇太极大喜，命人同尚可喜的使者一同回鹿岛，让尚可喜“幸勿犹豫，速赐回音”，并安排后金兵接应尚可喜。
崇祯七年（1634年），尚可喜在鹿岛起事，将不愿意降金的明朝副将俞太亮等拿下，并一路向西攻下广鹿岛、大小长山岛、石城岛、海洋岛五座明方海岛，将岛上明军将士尽行俘获，作为献给皇太极的见面礼。二月，尚可喜率万余人浩浩荡荡，航海降金。
到了这个时候，皇太极已经看得出明廷确实已经是外强中干，手下的大臣们纷纷鼓噪攻入关内。
不过有汉臣建议皇太极称帝，那汉臣说西边刘元昭已经在蒙古称帝，而南边的明廷已经是外强中干，刘元昭一定也在打主意吞并明廷。
而大金不弱于刘元昭，理当称帝，之后取代大明。
皇太极等人对此事怦然心动。