在福州停驻大半个月，清理震慑一番周边海商后，舰队一路南下直往濠境，此地住着不少的葡萄牙人，更有葡萄牙王室在此做总督。
濠境居住葡萄牙人一事由来已久，他们依赖“谦卑的态度和礼物”使广东海道及相关官员自此视而不见。
之后前往濠境的葡人逐年增多且至于携家带眷，一些不法分子拒受汉官约束，不遵大明法度，招致广东地方乃至朝廷诟病，遂有嘉靖末年朝野上下“驱逐澳夷”之声，有识之士纷纷敦请朝廷对澳门葡人严加管理，不同趋向的建言策论为此还展开了长期而激烈的争辩。
虽然有这样的言论，但是一直没有施行，反倒是国家实力开始衰退时，朝廷为了对澳葡控驭策略、贸易、税费和防务等方面考虑，明朝廷在反复权衡之后决定放弃以饬令或武力驱逐的办法，改而接受张鸣冈和霍与瑕等人的奏请，允准葡人继续租住澳门，但须加强防范和管理，即所谓“建城设官而县治之”。
也就是说居住在澳门的葡萄牙人是被看作中国皇帝子民的，葡萄牙人犯罪可由葡萄牙人自行处置；但一有牵涉华人，则须交中国官员审判，常有葡萄牙人被送去广州审判而受鞭打。
不过自进入天启之后，葡萄牙人就以荷兰人入侵为借口，擅自修建防御工事，此事是官府不可容许的事情。
正所谓“普天之下，莫非王土”，朝廷对于澳门土地的管理是十分严格的。
朝廷虽然允准葡人居留澳门，但明文禁止他们在此擅自兴作：不仅规定葡人不得买卖土地，还规定不经广东地方官员准许，也不得在澳门建造房屋或改造、扩建房屋，否则要受到明政府的干预和惩处。
例如1614年广东官府颁布五款《海道禁约》，其中之一便是“禁擅自兴作”的规定：“凡澳中夷寮，除前已落成，遇有破烂，准照旧式修葺，此后敢有新建房屋，添造亭舍，擅兴一土一木，定行拆毁焚烧，仍加重罪”。
据地方志载：“时徐如珂署海道副使，澳夷奔告红毛将犯香山，请兵请饷请木石以缮垣墉，如珂昌言于两府：‘此澳夷尝我也’。
已而夷警寂然，而澳夷日筑百丈，如珂遣中军领兵戍澳，谕之曰：‘垣墉不毁，澳人力少也，吾助若毁。’不两日，粪除殆尽”，自此葡人稍戒心。
1624年澳门总督马士加路也借口防御荷兰侵扰而在青洲筑城，建起三巴寺等六座炮台，又筑南、北两段围牌，并在沙梨头一带建造一个规模巨大的城堡，城堡周围的高墙上环架数十门大炮，并建一道夹墙与大炮台相通；他还计划在中间空地建筑宫殿和高塔作为自己的驻地。
此事被两广总督何士晋得悉，他不能容忍他们如此任意兴建城堡，遂传令澳葡予以拆除，但马士加路也蛮横拒绝，于是何士晋与已升任领西道的蔡善继通力合作，“首绝接济，以扼夷之咽喉；既絷揽头，以牵夷之心腹；官兵密布，四面重围；严拿奸党，招回亡命”。
面对大明官府的举动，马士加路不得不拆除这些防御工事。可见广州方面对于濠境的管理还是有效的。
这一次水师抵达濠境，就是朱园想解决此事，联合舰队出现在濠境海面上时，当地参将陈轩荣带着葡人总督马士加路和他的手下前来迎接。