墨菲享受了不到两天的时间，救世主尼奥又一次站在了自己的面前，这个速度不能说快也不能说慢，毕竟双方之间是战争，每时每刻都有人类死亡，而‘矩阵’一方死亡的不过是机械体罢了。
墨菲不知道发生了什么，为什么尼奥又来了，这个对于他来说并不满意，也不知道他的能力有没有体现在现实中？
“你来的到是很快，不过我想知道你在现实中是否有什么不同呢？”墨菲歪着脑袋上下打量着尼奥，随后问道。看不出来，毕竟这里是虚拟世界，尼奥依然是原来的样子，墨菲只能问问了。
“你怎么知道我在现实中会有变化？你对一切都很了解吗？”这次尼奥也是疑惑的很，对方好像知道的很多，一切都好像是他在掌控之中一样。
“知道的不少，需要的更多，解释就不用了，让我看看你又有什么变化，敢于再次出现在我面前？”墨菲可没有给对方解释的义务，他现在想要知道尼奥在现实中是否有了变化，自己怎么才能得到这种能力？
尼奥摆出了架势，但是墨菲并不看好在虚拟世界中他和自己战斗，对方必然有什么想法，不然不会这么明目张胆的站在自己面前。
墨菲思考了一下，‘是第三部中干掉史密斯的方式吗？’
第三部中史密斯在虚拟世界也算是无敌的存在了，尼奥被打的半死，随后被史密斯同化，而此时是‘矩阵’帮助尼奥进行连接，随后‘矩阵’加大能量的输入，通过尼奥的身体进行传递。不过传递的能量还是病毒不得而知，史密斯从内部开始崩溃，随后全部消灭，虚拟世界恢复了正常。
墨菲笑了笑，如果是这样的方式，没准自己不用去找‘矩阵’的端口，直接通过尼奥就可以将他们两个同时抓住，试试吧！
尼奥冲了过来，不过和上次没有什么区别，墨菲轻松的抓住了尼奥的拳头，“你没有什么进步啊，是谁给你的信心再次挑战我呢？”自大的表现是一定要的，毕竟对方也不傻，演戏就要演的专业。
墨菲轻松的完虐着尼奥，抓着他的拳头不断的摔打着，抡起来砸向地面，远方的墨菲斯和崔妮蒂看的一阵揪心。
……
墨菲斯的飞船冲向‘矩阵’的主机位置，这需要莫大的勇气，迎面而来的是铺天盖地的机械章鱼，另外还有大型的战舰，他们就像是海洋中的一叶小舟。
大家抱着必死的决心进行冲击，尼奥不负众望的在现实中掌握了能力，死亡的威胁让他有了突破，不过他们的力量太小了，根本无法对抗‘矩阵’，飞船坠毁，尼奥面对‘矩阵’提出了计划。
‘矩阵’最后同意了，墨菲的威胁对它来说太大了，毕竟他不可能放弃虚拟世界，饲养的人类需要一个精神世界，这样他们才会在里面沉睡而无法自拔。而‘矩阵’在虚拟世界中无法定位墨菲的位置，即便墨菲就站在那里进行破快，它都找不到墨菲。
于是尼奥再次来到墨菲的面前，他是要牺牲自己，让‘矩阵’可以采取现实中的手段对付墨菲，当然他们不知道墨菲到底是什么，为什么这么强大，但总是无法逃脱一个规律，墨菲是一个程序，他们如此判断。